Preview only show first 10 pages with watermark. For full document please download

Budowa, Replikacja, Systematyka Wirusów

   EMBED


Share

Transcript

WIRUSY CHOROBOTWÓRCZE DLA CZŁOWIEKA TOK BADANIA WIRUSOLOGICZNEGO METODY STOSOWANE W DIAGNOSTYCE WIRUSOLOGICZNEJ Katedra i Zakład Mikrobiologii Lekarskiej Anna Majewska Warszawa, 2016 OGÓLNA CHARAKTERYSTYKA WIRUSÓW • Małe rozmiary (20 nm-300 średnicy) • Brak budowy komórkowej • Zależą całkowicie od żywych komórek • Nie rosną na podłożach sztucznych • Bezwzględne pasożytnictwo wewnątrzkomórkowe • Posiadają jeden rodzaj kwasu nukleinowego • Nie namnażają się przez podziały • Są niewrażliwe na antybiotyki Budowa wirusa kwas nukleinowy (DNA lub RNA) DNA jest zwykle dwuniciowy (wyjątek parwowirusy) RNA jest zwykle jednoniciowy (wyjątek reowirusy) jednoniciowy RNA - o dodatniej (mRNA) lub ujemnej polarności (transkrypcja do kopii o dodatniej polarności) kwas nukleinowy + kapsyd = nukleokopsyd Funkcje kapsydu: • ochronna • udział w adsorpcji i wnikaniu wirusa do komórki przez interakcje z receptorami błony komórkowej pojedynczy segment wielosegmentowy Nukleokapsyd o symetrii ikosaedralnej adenowirusy herpeswirusy pikornawirusy liczba kapsomerów jest cechą taksonomiczną Nukleokapsyd o symetrii helikalnej (spiralnej) • kapsomery spiralnie otaczają kwas nukleinowy • wydłużony kształt rabdowirusy filowirusy wirus Ebola Osłonka nabyta z błony komórkowej podczas późnych faz replikacji glikoproteiny przyleganie do receptorów komórkowych pobudzanie interakcji z białkami nukleokapsydu (dojrzewanie potomnych cząstek wirusa) osłonka wirusa wszystkie wirusy o symetrii helikalnej wirusy o symetrii ikosaedralnej: togawirusy herpeswirusy retrowirusy flawiwirusy wirusy bezosłonkowe oporne na wysuszenie, detergenty, ekstremalne pH i temperatury przenoszone droga oddechową i fekalno-oralną wirusy osłonkowe wymagają wilgotnego środowiska, wrażliwe na kwasy i detergenty Białka wirusowe  strukturalne  enzymatyczne  polimerazy wirusowe (replikacja)  proteazy  modyfikacja dużych protein w procesie translacji, uwolnienie kwasu nukleinowego z nukleokapsydu  endonukleazy i ligazy (replikacja) Postaci pozakomórkowa spoczynkowa – wirion wewnątrzkomórkowa aktywna – pozbawiony białkowego płaszcza komórka zarażona wirusem wścieklizny: liczne wirusy (szare, pałeczkowate struktury) i większe, ciemniejsze ciałka wtrętowe Negriego Kryteria uwzględniane w klasyfikacji wirusów wygląd, kształt i wielkość, cechy kwasu nukleinowego, • typ, • liczba nici i ich postać (s, ds, liniowy, kolisty), • liczba segmentów, • masa cząsteczkowa, • polarność genomu wirusowego, symetria nukleokapsydu, obecność osłonki lub jej brak, stopień pokrewieństwa antygenowego, Replikacja wirusów • adsorpcja • wniknięcie • odpłaszczenie • synteza białek wczesnych • powielenie genomu • synteza białek późnych • składanie i dojrzewanie wirionów potomnych • uwolnienie dojrzałych wirionów WIRUS RECEPTOR RECEPTOR KOMÓRKOWY WIRUSOWY Reowirusy HIV cząstka CD4 gp120 sialyloligosacharydy hemaglutynina Ortomyksowirus Wirus grypy Rabdowirus Wirus wścieklizny receptor acetylocholinowy białko G receptor hepatocytowy Pre-S Hepadnawirusy HBV Penetracja Fuzja wirusowej osłonki z błona komórkową Białko fuzji, doprowadza do połączenia osłonki wirusowej z błoną komórkową, do cytoplazmy dostaje się nukleokapsyd, z którego uwalnia się kwas nukleinowy (odpłaszczanie) Translokacja – bezpośrednie przejście wirusa przez błonę komórkową, małe wirusy penetracja Endocytoza Wpuklenie błony komórkowej. Wirus zamknięty w pęcherzyku pokrytym klarytyną, który wędruje w głąb cytoplazmy odpłaszczanie proteazy wirusowe trawią białka ochronne uwolnienie kwasów nukleinowych synteza  Replikacja kwasu nukleinowego  Synteza białek wirusowych DNA przemieszcza się do jądra komórkowego Dojrzewanie – formowanie wirionów potomnych wirusy osłonkowe egzocytoza, odzyskanie osłonki lipoproteinowej (ortomyksowirusy, paramyksowirusy) wirusy nagie – liza komórki Wirusy lityczne Cykl rozwojowy wirusa doprowadzający do rozpadu (lizy) atakowanej komórki Wirus wnika do komórki, „zmusza” ją do powielenia wirusowego kwasu nukleinowego i do syntezy wirusowych białek. Powstają potomne cząsteczki wirusa, które opuszczają komórkę, niszcząc ją. Wirusy lizogenne Wirus nie powoduje śmierci komórki, ulega włączeniu do komórkowego DNA. DNA wirusa jest przekazywany komórkom potomnym w procesach podziałów komórkowych. Zjawisko to uznaje się za przyczynę niektórych zmian nowotworowych, a wirusy je wywołujące nazywamy wirusami onkogennymi. Drogi zakażenia  powietrzna  inhalacyjna  pokarmowa  fekalno-oralna  wertykalna  krwiopochodna  kontakt płciowy  wektory  autoinokulacja  kontakt bezpośredni (zakażone powierzchnie)  Zakażenie pierwotne  Zakażenie wtórne (latencja)  Zakażenie miejscowe  Zakażenie narządowe Wiremia zakażenie narządów docelowym (tropizm OUN, wątroba, płuca, jelita, skóra, wirusy pantropowe) latencja zakażenie latentne, utajone komórki nerwowe – HSV-1, HSV-2, HHV-3 limfocyty B – HHV-4 (EBV) limfocyty T – HHV-5 (CMV) reaktywacja ze stanu latencji – czynniki reaktywacji: bodźce termiczne, psychiczne, fizyczne, hormonalne, zakaźne OBJAWY ZAKAŻENIA pierwsze objawy: gorączka, bóle mięśniowe, złe samopoczucie – aktywacja dopełniacza i uwalnianie cytokin objawy miejscowe – wysypka, obrzęk ślinianek, nieżyt nosa – działanie cytopatogenne wirusa objawy narządowe – ostra faza choroby procesy nowotworowe zakażenia przetrwałe – retrowirusy, papillomawirusy zakażenia wertykalne – zakażenie płodu, noworodka materiał diagnostyczny  wczesna postekspozycja  faza objawów klinicznych (wirusy oddechowe)  ozdrowieńcy  kontrola postępów leczenia  wymaz z błony śluzowej nosa i gardła  plwocina  krew/surowica krwi  moc, kał  wymazy ze zmian skórnych, zeskrobiny  aspiraty  fragmenty tkanek metody diagnostyczne  obraz kliniczny  hodowla komórkowa,  obserwacja mikroskopowa: CPE, immunofluorescencja, mikroskopia elektronowa  wykrywanie „składników” wirusowych  wykrywanie przeciwciał Hodowla wirusów diagnozowanie zakażeń badania naukowe produkcja antygenów (szczepionki, testy diagnostyczne) Metody hodowli hodowle komórkowe żywe układy: zwierzęta laboratoryjne zarodki ptasie ZARODKI PTASIE KURZE - 1931 rok - KACZE, PRZEPIÓRKI JAPOŃSKIE wirus świnki wirus grypy zwierzęta laboratoryjne (myszy, świnki morskie, króliki, chomiki) HODOWLE KOMÓRKOWE (1925rok – WIRUS KROWIANKI W HODOWLI TKANKOWEJ, F. PARKER ) Hodowle komórkowe PIERWOTNE Komórki uzyskane ze świeżo izolowanych tkanek lub narządu WTÓRNE - USTABILIZOWANE PÓŁCIĄGŁE CIĄGŁE diploidalne, aneuploidalne, ograniczona liczba pasaży (40-50), najczęściej wywodzą się utrzymują swój garnitur chromosomalny, z tkanki nowotworowej, ulegają aberracji i degeneracji, VERO, HeLa, (MRC-5, WI-38), Hodowle komórkowe Hodowla w naczyniach – szkło, nietoksyczny plastik – przyleganie do powierzchni tworząc jednowarstwową hodowlę – monolayer Hodowla w zawiesinie – mieszadła magnetyczne Pożywki do hodowli komórkowych zawierają - cukry, - aminokwasy, - witaminy, - sole mineralne, - związek buforujący (do pH 7,2-7,4), - wskaźnik barwny pH, - antybiotyki, - surowicę (najczęściej płodową cielęcą) w stężeniu 10-20% pożywka wzrostowa w stężeniu 2-5% pożywka utrzymująca WARUNKI HODOWLI temperatura 37ºC, stężenie CO2 5%, wilgotność Permisywność  Wirus zakaża się i replikuje tylko w tych liniach komórkowych, których komórki zawierają odpowiedni dla gatunku wirusa receptor (komórki permisywne, zezwalające) NAZWA TKANKA POCHODZENIE WIRUS MORFOLOGIA HeLa człowiek rak szyjki macicy nabłonkowa Polio 1, adenowirusy, herpeswirusy Hep-2 człowiek rak krtani nabłonkowa Polio 1, adenowirusy, flawiwirusy nerka fibroblasty adenowirusy, herpeswirusy BHK-21 chomik Vero małpa nerka nabłonkowa SV 40, herpeswirusy WI-38 człowiek płuca fibroblasty Polio 1, 2, VSV, adenowirusy PK świnia nerka nabłonkowa VSV, Coxsackie B2 - B6, flawiwirusy, herpeswirusy nie wszystkie wirusy mogą namnażać się we wszystkich liniach komórkowych, wirus replikuje się tylko w komórce permisywnej tj. zezwalającej, która posiada odpowiedni dla danego wirusa receptor. Hodowle komórkowe stosowane w celach diagnostycznych, naukowych, produkcyjnych VERO Vero (komórki nabłonkowe z zielonej małpy afrykańskiej) wielojądrowe komórki olbrzymie Micrograph showing the viral cytopathic effect of herpes simplex virus (multi-nucleation, ground glass chromatin). A – okołojądrowe „halo” , powiększone hyperchromatyczne jądro B – duże jądro, nieregularne rozmieszczenie chromatyny, nieregularna osłonka HAdV – ludzkie adenowirusy Metody wykrywania wirusów ZMIANY CYTOPATYCZNE (CPE) WTRĘTY- ciałka wtrętowe, widoczne w barwionych, zakażonych komórkach za pomocą mikroskopu świetlnego. Są to skupiska wirusów lub wirusy otoczone komórkowymi elementami białkowymi i lipidowymi lub składniki komórkowe powstałe pod wpływem zmienionego metabolizmu zakażonej komórki. wtręty cytoplazmatyczne wtręty jądrowe (herpeswirusy) Wtręty A (HSV, VZV) – ostro odgraniczone, otoczone jasną przestrzenią od chromatyny jądrowej Wtręty B (poliowirus, żółtej febry) – mniejsze. Wtręty jądrowe i cytoplazmatyczne (wirus odry) CPE - wirus odry w linii komórkowej HeLa, syncytia, wtręty cytoplazmatyczne (barwienie hematoksyliną) Hepatocyt – wewnatrzjądrowe wtręty, otoczone strefą „halo”. barwienie H&E. Wielojądrzaste komórki olbrzymie syncytia np. paramyksowirusy, herpeswirusy Skupiska powiększonych i zaokrąglonych komórek, utrata mostków cytoplazmatycznych (grona winogron) - adenowirusy zaokrąglenie i obkurczenie komórek. liza (zniszczenie warstwy komórek) np. poliowirus Efekt cytopatyczny powodowany przez wirusa HHV-1 hodowla prawidłowa (linia Vero) CPE Efekt cytopatyczny powodowany przez poliowirusy hodowla prawidłowa (linia Vero) CPE c Efekt cytopatyczny powodowany przez cytomegalowirusa Efekt cytopatyczny powodowany przez wirusa Coxsackie A hodowla prawidłowa (linia PMK) CPE Transformacja nowotworowa komórek wzrost jednowarstwowy zastąpiony jest chaotycznym i wielowarstwowym, grudkowate skupiska, aberracje chromosomów HHV-8 Mięsak Kaposiego HPV – typy onkogenne HHV-4 (EBV) Chłoniak Burkitta ZMIANY NIECYTOPATYCZNE 1. Hemadsorpcja ortomyksowirusy, paramyksowirusy 2. Interferencja podwójne zakażenie = oporność na zakażenie komórki innym wirusem Hemaglutynacja [Hirst 1941] Stosowania do wykrywania wirusów posiadających na swej otoczce hemaglutyniny np. wirusa grypy Uwolnione wirusy w pożywce hodowlanej + krwinki czerwone = aglutynacja erytrocytów konglomeraty erytrocytarnowirusowe Dokładna identyfikacja wirusa namnożonego w hodowli komórkowej wymaga zastosowania dodatkowych technik diagnostycznych zdjęcia wykorzystane w prezentacji pochodzą z ogólnie dostępnych stron internetowych