Transcript
Charakterystyka kwasów nukleinowych i mechanizmy przekazywania
informacji genetycznej
Deoksyrybonukleotyd
5’ 4’ 3’
1’ 2’
5’ 4’ 3’
1’ 2’
Deoksyrybonukleotyd
Rybonukleotyd
+ NAD(P)
+ NAD
Dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy
Wiązanie fosfodiestrowe
Tymina Pirymidyna
Cytozyna
Pirymidyna
Adenina
Puryna
Guanina Puryna
Składniki DNA Zasada azotowa Adenina
(puryna) Guanina
(puryna) Tymina
(pirymidyna) Cytozyna
(pirymidyna)
Nukleozyd
(zasada + deoksyryboza)
Nukleotyd (mono-P nukleozydu)
Nukleotyd (tri-P nukleozydu)
Deoksyadenozyna
Monofosforan deoksyadenozyny
Trifosforan deoksyadenozyny
Deoksyguanozyna
Monofosforan deoksyguanozyny
Trifosforan deoksyguanozyny
Deoksytymidyna
Monofosforan deoksytymidyny
Trifosforan deoksytymidyny
Deoksycytydyna
Monofosforan deoksycytydyny
Trifosforan deoksycytydyny
Nukleosom Histony i DNA
Epigenetyka Euchromatyna
Acetylacja
Heterochromatyna
Metylacja
Fosforylacja
barw. DNA barw. chr. X
Przykład epigenetyki Ciałko Barra
XXi XY
Resweratrol Euchromatyna
Heterochromatyna Sirtuiny
Dlaczego komplementarność? •
Replikacja (kopiowanie)
•
Transkrypcja (przepisywanie)
•
Translacja (tłumaczenie)
Replikacja DNA
Kierunek syntezy DNA
5′
3′
kierunek syntezy
Widełki replikacyjne
Fragmenty Okazaki 3′
5′
3′
5′
3′
5′ 5′
3′
Fragmenty Okazaki 3′
5′
3′
5′
3′
5′ 5′
3′
Fragmenty Okazaki 3′
5′
3′
5′
3′
5′ 5′
3′
Fragmenty Okazaki 3′
5′
3′
5′
3′
5′ 5′
3′
Fragmenty Okazaki 3′
5′
3′
5′
3′
5′ 5′
3′
Kwasy nukleinowe DNA
RNA
Cukier
Deoksyryboza
Ryboza
Zasady azotowe
Adenina (A)
Cytozyna (C)
Guanina (G)
Tymina (T)
Adenina (A)
Cytozyna (C)
Guanina (G)
Uracyl (U)
Stabilność chemiczna
Duża
Mała
Struktura tRNA
RNA Typ
Funkcja
mRNA
Przenosi informacje z DNA do rybosomów
tRNA
“Tłumaczy” kodony mRNA na aminokwasy
rRNA
Katalizuje syntezę białek i utrzymuje strukturę rybosomów
snRNA
Bierze udział w splicingu pre-mRNA
siRNA
miRNA
Reguluje aktywność transkrypcyjną
Gdzie, które? DNA Transkrypcja (siRNA, miRNA)
Pre-mRNA Splicing (snRNA) AUG .................... CGC .. UGA
MetionylotRNA ArginylotRNA
UAC Met
GCG Arg
Met ..................... Arg ...
mRNA ACU Stop
Translacja (rRNA)
Białko
TATA box TATA binding protein
rozpoznaje TATA box TATA box
miejsce rozpoczęcia transkrypcji
TBP
Kod genetyczny DNA
ATGGCCAATGATGCCCGTTATAATGCCTGA TACCGGTTACTACGGGCAATATTACGGACT RNA
AUGGCCAAUGAUGCCCGUUAUAAUGCCUGA Białko
M
A
N
D
A
R
Y
N
A
*
Kod genetyczny 3. zasada kodonu
1. zasada kodonu
2. zasada kodonu
Czynniki transkrypcyjne
Helisa-zakręt-helisa
Suwak leucynowy
Suwak leucynowy
Czynnik transkrypcyjny
Gen SRY
Remodeling chromatyny
promotor genu
Remodeling chromatyny
promotor genu
Remodeling chromatyny czynnik transkrypcyjny i polimeraza RNA
transkrypcja
TATA-box promotor genu
small interfering RNA
Zahamowanie translacji Ferrytyna magazynuje i transportuje żelazo Mało żelaza
Dużo żelaza
Sekwencjonowanie Sangera
CACCCACACACACCACACCCACACACCACACCCACACCACCCACACACACACCACACCCACACCCACACACACCACACCCACACACCACACCCACACCACCCACACACACACCACACCCACACCCACACACACCACACCCACA CTCGCGCTGTCACACCTTACCCGGCTTTCTGACCGAAATACTCTCTCTCATCTACCTTTACTCGCGCTGTCACACCTTACCCGGCTTTCTGACCGAAATACTCTCTCTCATCTACCTTTACTCGCGCTGTCACACCTTACCCG CCTGTTCTTTAGCCCTACAACACTTTTACATAGCCCTAATAAAAAAAATGAAAATGAAATCCTGTTCTTTAGCCCTACAACACTTTTACATAGCCCTAATAAAAAAAATGAAAATGAAATCCTGTTCTTTAGCCCTACAACAC TTACGTCTCCTCCAAGCCCTATTGACTCTTACCCGGAGTATAGCCCTAAATAGCCCTCATTTACGTCTCCTCCAAGCCCTATTGACTCTTACCCGGAGTATAGCCCTAAATAGCCCTCATTTACGTCTCCTCCAAGCCCTATT CTACCTTTATTTTATGTTTACTTTTTATAGACTGTCTTTTTCAGCTAAAAGCTATACTTACTACCTTTATTTTATGTTTACTTTTTATAGACTGTCTTTTTCAGCTAAAAGCTATACTTACTACCTTTATTTTATGTTTACTT GTCTCTCGCTACTGCCGTGCAACAAACACTAAATCAAAATCATCCTACTCCTTCGCACTTGTCTCTCGCTACTGCCGTGCAACAAACACTAAATCAAAATCATCCTACTCCTTCGCACTTGTCTCTCGCTACTGCCGTGCAAC CGCATATTCCCTAGAAAAAAATTTTCTTACAATATACTACAGTAAAATACTACATCAAAACGCATATTCCCTAGAAAAAAATTTTCTTACAATATACTACAGTAAAATACTACATCAAAACGCATATTCCCTAGAAAAAAATT TGACTTTCGTAACAACAATTTCCTTCACTCTCCAACTTCTACTACACAATACATAATCAGTGACTTTCGTAACAACAATTTCCTTCACTCTCCAACTTCTACTACACAATACATAATCAGTGACTTTCGTAACAACAATTTCC TAATATATCAAATCTACCGTCTGGAACATCATCGCTATCTCTGCTCGAATCCCTACATAATAATATATCAAATCTACCGTCTGGAACATCATCGCTATCTCTGCTCGAATCCCTACATAATAATATATCAAATCTACCGTCTG CATCAGCATGTACAGTGGTACCCTCGTGTCATCTGCAGCCAGCTCTTTGTGAACCGCTACCATCAGCATGTACAGTGGTACCCTCGTGTCATCTGCAGCCAGCTCTTTGTGAACCGCTACCATCAGCATGTACAGTGGTACCC ATCAAGCCAATGTGGTAACAACCACACCTCCGAAATCTGGAGAACTTCAACGTTTGCCAAATCAAGCCAATGTGGTAACAACCACACCTCCGAAATCTGGAGAACTTCAACGTTTGCCAAATCAAGCCAATGTGGTAACAACC CTGCCGAAATGTTTTATTGTAGAACAGCCCTATCAGCATCTCCAAAAGATACTCCAGTTTCTGCCGAAATGTTTTATTGTAGAACAGCCCTATCAGCATCTCCAAAAGATACTCCAGTTTCTGCCGAAATGTTTTATTGTAGA CGGCACTTTAGATGGGGTAACTCCCAGCGCAATCTGATCCGAGAGGAATGCCGTCCAATGCGGCACTTTAGATGGGGTAACTCCCAGCGCAATCTGATCCGAGAGGAATGCCGTCCAATGCGGCACTTTAGATGGGGTAACTC TAATTCATATCTGCTCCTCAACTGTCGATGATGCCTGCTTCGCAAGTGCATTCCTAGACTTAATTCATATCTGCTCCTCAACTGTCGATGATGCCTGCTTCGCAAGTGCATTCCTAGACTTAATTCATATCTGCTCCTCAACT CGGACCCTGCAGTCCAGCGCTCGTCATGGAACGCAAACGAAACTGCAGCTTGACGTACTGCGGACCCTGCAGTCCAGCGCTCGTCATGGAACGCAAACGAAACTGCAGCTTGACGTACTGCGGACCCTGCAGTCCAGCGCTCG GAGCGCTTCCACAACAACCGTATCGTCTTTTGCCTCCCACTGAAAAACTCCACCTTTCTCGAGCGCTTCCACAACAACCGTATCGTCTTTTGCCTCCCACTGAAAAACTCCACCTTTCTCGAGCGCTTCCACAACAACCGTAT GTCCCAGTTCAAAAAGTACTGCAGCACCTCTGTCTTCGATTCTTCCTGGCACTTTTTTTCGTCCCAGTTCAAAAAGTACTGCAGCACCTCTGTCTTCGATTCTTCCTGGCACTTTTTTTCGTCCCAGTTCAAAAAGTACTGCA TTTAAAATACAACTCTTTGATCTGCCTTCCAGACATGCGTTCACGCAAGTTGCTCCATACTTTAAAATACAACTCTTTGATCTGCCTTCCAGACATGCGTTCACGCAAGTTGCTCCATACTTTAAAATACAACTCTTTGATCT GCCTCTTGTCGAATCCAATACACTAATTGTTTCTCTTCTGAAAACTTGGCTCCCTTGCTTGCCTCTTGTCGAATCCAATACACTAATTGTTTCTCTTCTGAAAACTTGGCTCCCTTGCTTGCCTCTTGTCGAATCCAATACAC AGCATAATTTCTCTGTATCTGAGAGTAGATCTCTCTCCTTCTAGTAATGGCCAGGTACCAAGCATAATTTCTCTGTATCTGAGAGTAGATCTCTCTCCTTCTAGTAATGGCCAGGTACCAAGCATAATTTCTCTGTATCTGAG ATATCCTACAGGGTCCCCATGATATGGCTCGATGTCTTCTTTTACGCTAAAATATTTCAAATATCCTACAGGGTCCCCATGATATGGCTCGATGTCTTCTTTTACGCTAAAATATTTCAAATATCCTACAGGGTCCCCATGAT GTCATTTCGCAGCATTCTCTCCACAGCTAGTGCTTCCCACAAGTATTCTTTGTATTCCTCGTCATTTCGCAGCATTCTCTCCACAGCTAGTGCTTCCCACAAGTATTCTTTGTATTCCTCGTCATTTCGCAGCATTCTCTCCA TTTCTGGCCAGCCCAACAGACACAGAGCTCGAACATCTTAGCTATCCTCCGATACGATACTTTCTGGCCAGCCCAACAGACACAGAGCTCGAACATCTTAGCTATCCTCCGATACGATACTTTCTGGCCAGCCCAACAGACAC GTATTGTGTGAACACTCCCTCTGGGCAGAAGTATATGTCTTGACAGCCCTTGCATAATCCGTATTGTGTGAACACTCCCTCTGGGCAGAAGTATATGTCTTGACAGCCCTTGCATAATCCGTATTGTGTGAACACTCCCTCTG TTTAATTTCGTCAGACCGAAATCCAAGAAACTGTAAGACAATACCATAGAGGAAAAGATGTTTAATTTCGTCAGACCGAAATCCAAGAAACTGTAAGACAATACCATAGAGGAAAAGATGTTTAATTTCGTCAGACCGAAATC GGGAAATTGTGCTTTCAGTTTCTTTCTCTCTAGCAAAACATTCATATTCTCGGAAGTATTGGGAAATTGTGCTTTCAGTTTCTTTCTCTCTAGCAAAACATTCATATTCTCGGAAGTATTGGGAAATTGTGCTTTCAGTTTCT ATACGACTCTTTGTTAATGTCGGTGACTGGATGGAATCTCATTTGACTCCCTTTCCGCTTATACGACTCTTTGTTAATGTCGGTGACTGGATGGAATCTCATTTGACTCCCTTTCCGCTTATACGACTCTTTGTTAATGTCGG TTTATTGGCGTCCTCCTTGGCACTAGCGTTGGTACTTTCATTATCCTCAGCATTGCCATCTTTATTGGCGTCCTCCTTGGCACTAGCGTTGGTACTTTCATTATCCTCAGCATTGCCATCTTTATTGGCGTCCTCCTTGGCAC GGAGTTGGTACTTTCGGTGGTAGCAGCACTAGTGTTGGAAGTGGTAGTAGCACTAGTGTTGGAGTTGGTACTTTCGGTGGTAGCAGCACTAGTGTTGGAAGTGGTAGTAGCACTAGTGTTGGAGTTGGTACTTTCGGTGGTAG AGCATTAGTGCTGGAGTTGGTACTTTCAGTGGTAGTAGCGTTGGTACTTTCAGTGGTAGTAGCATTAGTGCTGGAGTTGGTACTTTCAGTGGTAGTAGCGTTGGTACTTTCAGTGGTAGTAGCATTAGTGCTGGAGTTGGTAC TTCAGTGGTAGTAGCATTAGTGTTGGAGTTGGTACTTTCATTAGTGCTGGAGTTGGTACTTTCAGTGGTAGTAGCATTAGTGTTGGAGTTGGTACTTTCATTAGTGCTGGAGTTGGTACTTTCAGTGGTAGTAGCATTAGTGT AGAGTTGATACTTTTAGTGGTAGTAGCACTAGTCCTGACAGTGGTAGTAGCATTAGTGCTAGAGTTGATACTTTTAGTGGTAGTAGCACTAGTCCTGACAGTGGTAGTAGCATTAGTGCTAGAGTTGATACTTTTAGTGGTAG CGCACTAGTGCTGGAGTTGGTACTTTCAGTGGTAGTAGCGTTGATGCTGGCAGTGGTAGTCGCACTAGTGCTGGAGTTGGTACTTTCAGTGGTAGTAGCGTTGATGCTGGCAGTGGTAGTCGCACTAGTGCTGGAGTTGGTAC GGCAGTGGTAGTAGCACTAGTGTTGGAGTTGGTACTTTCACTAGTCCTGACGTTGATGCTGGCAGTGGTAGTAGCACTAGTGTTGGAGTTGGTACTTTCACTAGTCCTGACGTTGATGCTGGCAGTGGTAGTAGCACTAGTGT GGAGTTGGTACTTTCAGTGGTAGTCGCATTAGTGCTGGAGGTGGTAGTAGCATTAGTGCTGGAGTTGGTACTTTCAGTGGTAGTCGCATTAGTGCTGGAGGTGGTAGTAGCATTAGTGCTGGAGTTGGTACTTTCAGTGGTAG AGCACTAGTCCTGACGTTGATGCTGGCAGTGGTAGTAGCGTTGGTACTTTCAGTGGTAGTAGCACTAGTCCTGACGTTGATGCTGGCAGTGGTAGTAGCGTTGGTACTTTCAGTGGTAGTAGCACTAGTCCTGACGTTGATGC GGCAGTGGTAGTAGCATTAGTGCTGGAGTTGGTAGTCGCACTAGTCCTGACGTTGGTGCTGGCAGTGGTAGTAGCATTAGTGCTGGAGTTGGTAGTCGCACTAGTCCTGACGTTGGTGCTGGCAGTGGTAGTAGCATTAGTGC CGCATTAGTACTGGCATTGGTACTGGCATTGGTAGTCGCATTGGTACTGGCATTGGTGGTCGCATTAGTACTGGCATTGGTACTGGCATTGGTAGTCGCATTGGTACTGGCATTGGTGGTCGCATTAGTACTGGCATTGGTAC CGCATTAGTCCTGACGTTGGTACTAGCAGTGGTAATCGCATTAGTACTAGCATTGGTAGTCGCATTAGTCCTGACGTTGGTACTAGCAGTGGTAATCGCATTAGTACTAGCATTGGTAGTCGCATTAGTCCTGACGTTGGTAC GGCATTAGCACTACCATGAATGCACGTGTTGCTGTCCTCATTAGTACTGGCGTTAGTACTGGCATTAGCACTACCATGAATGCACGTGTTGCTGTCCTCATTAGTACTGGCGTTAGTACTGGCATTAGCACTACCATGAATGC GTACCTGTCACTGCTATTGCTCTCCTGGAAGCTAGACGGATCACTGCTGCAATACTTTCTGTACCTGTCACTGCTATTGCTCTCCTGGAAGCTAGACGGATCACTGCTGCAATACTTTCTGTACCTGTCACTGCTATTGCTCT AGCTGTCGCCTGTTTTTCAGCCAATCTGTCCATTCTTTCTAACGCAACGATCGACATGGAAGCTGTCGCCTGTTTTTCAGCCAATCTGTCCATTCTTTCTAACGCAACGATCGACATGGAAGCTGTCGCCTGTTTTTCAGCCA AGACAGGTCTGTCCTGGAGCCACAGCATCCAACATGCTGTATCAGTTCCACTGTGTCAGCAGACAGGTCTGTCCTGGAGCCACAGCATCCAACATGCTGTATCAGTTCCACTGTGTCAGCAGACAGGTCTGTCCTGGAGCCAC TTCAAGTCCATAGAACTCGCGTACCTGTTCGGTTATACAGCCCTTTTTTCCTTTCTTTGATTCAAGTCCATAGAACTCGCGTACCTGTTCGGTTATACAGCCCTTTTTTCCTTTCTTTGATTCAAGTCCATAGAACTCGCGTA TTCACCCTTACGATTCCTTGCCGCCCAACTGTTTTTTCTGCCTTCCTTAATTGGTGGTAATTCACCCTTACGATTCCTTGCCGCCCAACTGTTTTTTCTGCCTTCCTTAATTGGTGGTAATTCACCCTTACGATTCCTTGCCG CCCATCTCTTAGTCTCCCTACACCTTGAATGAGCTCAATAGATAATAGATAACAGAGGCCCCCATCTCTTAGTCTCCCTACACCTTGAATGAGCTCAATAGATAATAGATAACAGAGGCCCCCATCTCTTAGTCTCCCTACAC CATGATCACCATCATCAATTGCTTAATGTCAATTCCTTCAATATTAAGTCTATTATCAAGCATGATCACCATCATCAATTGCTTAATGTCAATTCCTTCAATATTAAGTCTATTATCAAGCATGATCACCATCATCAATTGCT GAGAACTTGCATGCTACCGTCAGTGACAAACTCCTTTGTAGTCACTAATTTCGTTCCGATGAGAACTTGCATGCTACCGTCAGTGACAAACTCCTTTGTAGTCACTAATTTCGTTCCGATGAGAACTTGCATGCTACCGTCAG ACCCAGCTTCCCGTGTATCCATACCACCCTAAAATACTTGCGAGACACCTTTTCTGCAGCACCCAGCTTCCCGTGTATCCATACCACCCTAAAATACTTGCGAGACACCTTTTCTGCAGCACCCAGCTTCCCGTGTATCCATA TTCCACTTCGTTGGTTGTGCTTGCAACTACAATGGCCTTTCTCCAAGAGCAGGCCAATTCTTCCACTTCGTTGGTTGTGCTTGCAACTACAATGGCCTTTCTCCAAGAGCAGGCCAATTCTTCCACTTCGTTGGTTGTGCTTG GAGGGCTAAAAGAAGCTTCAGTGCTTCTTCGGGCTGTGACGACTCTGGTTCACTTTCAAAGAGGGCTAAAAGAAGCTTCAGTGCTTCTTCGGGCTGTGACGACTCTGGTTCACTTTCAAAGAGGGCTAAAAGAAGCTTCAGTG ATGAACATGCCCTAAAGGCACCTCGGATTTCTCCTTGATTTCCACTTTCTTCCGAATTTTATGAACATGCCCTAAAGGCACCTCGGATTTCTCCTTGATTTCCACTTTCTTCCGAATTTTATGAACATGCCCTAAAGGCACCT ATAGCTGGATAGACCTCTGCTGAGATCTTCCGACCGTTTTAGATTAAACATCCGTGTTGGATAGCTGGATAGACCTCTGCTGAGATCTTCCGACCGTTTTAGATTAAACATCCGTGTTGGATAGCTGGATAGACCTCTGCTGA TTTCTTGGCCAGTCCCGTAAGCCCAATACGCTGCAACGCGAGCTCGTTGATGTCCATCGATTTCTTGGCCAGTCCCGTAAGCCCAATACGCTGCAACGCGAGCTCGTTGATGTCCATCGATTTCTTGGCCAGTCCCGTAAGCC
Dane genomowe
Single Nucleotide Polymorphism
Fluorescent in situ hybridization